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一个有关chip-seq的问题我想做测的2个chip-seq重复间的peak的相关性,用的是intersectBed-aa.bed-bb.bed-f0.05这样来找overlap的peak的个数,然后用intersectBed-aa.bed-bb.bed-f0.05-v来分别找sample1和sample2
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更新时间:2024-04-29 07:10:41
问题描述:

一个有关chip-seq的问题

我想做测的2个chip-seq重复间的peak的相关性,用的是intersectBed-aa.bed-bb.bed-f0.05这样来找overlap的peak的个数,然后用intersectBed-aa.bed-bb.bed-f0.05-v来分别找sample1和sample2各自独有的peak数.再画维恩图看它们各自重叠的和非重叠的有多少,

廖恒成回答:
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