A、利用秋水仙素处理萌发的种子或幼苗,得到多倍体植株,是植物的正常发育,没有利用植物组织培养技术,A错误;
B、花药离体培养得到单倍体植株采用了植物组织(花粉)培养技术,B正确;
C、利用基因工程培育抗虫棉的过程:①在棉花的植株上提取叶肉细胞,②在苏云金杆菌上提取相应基因,③将提取基因导入植物叶肉细胞的DNA(利用基因重组技术),④通过培养既培养出愈伤组织,进行再分化,⑤最后通过组织培养技术,得到含抗虫基因的棉花植株,C正确;
D、运用细胞工程培育“番茄-马铃薯”杂种植株,需要采用植物组织培养技术将杂种细胞培养成杂种植株,D正确.
故选:A.